01. Mobilna faza
GC koristi gas kao mobilnu fazu, poznat i kao gas nosač. Uobičajeni gasovi nosači uključuju helijum, azot i vodonik. U poređenju sa HPLC-om, GC ima manje tipova mobilnih faza i manji opseg opcija. Glavna funkcija gasa-nosača je da uvede uzorak u GC sistem radi odvajanja, a njegov uticaj na rezultate separacije je ograničen.
U HPLC-u postoje mnoge vrste mobilnih faza koje uvelike doprinose rezultatima razdvajanja. Gledajući iz drugačije perspektive, optimizacija radnih parametara GC-a je relativno jednostavnija od HPLC-a. Osim toga, trošak GC plina nosača je niži od cijene HPLC mobilne faze.
02. Fiksna faza
Zbog relativno ograničenih tipova nosećih gasova u GC-u, njegova selektivnost separacije je uglavnom promenjena različitim stacionarnim fazama, posebno u nabijenoj koloni GC gde je stacionarna faza često sastavljena od nosača i fiksirane tečnosti obložene na svojoj površini, koja ima odlučujući uticaj na razdvajanje. Stoga je to dovelo do razvoja i istraživanja širokog spektra GC stacionarnih faza. Do sada su nam na raspolaganju stotine GC stacionarnih faza, ali postoji samo desetak uobičajeno korišćenih HPLC stacionarnih faza.
Stoga se LC u velikoj mjeri oslanja na odabir različitih mobilnih faza za promjenu selektivnosti razdvajanja. Naravno, postoji samo desetak najčešće korištenih stacionarnih faza za kapilarni GC. U praktičnoj analizi, GC generalno bira gas nosač i optimizuje separaciju promenom hromatografske kolone (tj. stacionarne faze) i radnih parametara (temperatura kolone, brzina protoka gasa-nosača, itd.), dok LC često optimizuje separaciju promenom tipa i sastava mobilne faze i radnih parametara (temperatura kolone, brzina protoka mobilne faze, itd.) nakon odabira hromatografske kolone.
03. Objekt analize
Uzorci koji se mogu direktno odvojiti pomoću GC-a su isparljivi i termički stabilni, sa tačkom ključanja generalno ne većom od 500 stepeni. Prema relevantnim statističkim podacima, 20% do 25% poznatih jedinjenja može se direktno analizirati GC, dok se ostatak može analizirati LC u principu. To znači da GC ima mnogo manje objekata analize nego LC.
Treba istaći da se neki uzorci koji se ne mogu direktno analizirati GC-om mogu indirektno analizirati GC-om kroz posebne tehnike ubrizgavanja kao što su ubrizgavanje u prostor i pirolizno ubrizgavanje. Na primjer, kreking kromatografija polimernih materijala je ovakva. Ovo u određenoj mjeri proširuje opseg objekata GC analize. Osim toga, GC je pogodniji za analizu gasa od LC.
04. Tehnologija testiranja
Postoje različite tehnike detekcije koje se obično koriste u GC-u, kao što su detektor toplotne provodljivosti (TCD), detektor ionizacije plamena (FID), detektor hvatanja elektrona (ECD), detektor azot-fosfora (NPD), itd. Među njima, FID reaguje na većinu organskih spojeva i ima visoku osjetljivost, s minimalnom granicom detekcije do nanograma.
Međutim, ne postoji visoko osjetljiv detektor sa tako dobrom univerzalnošću u LC. Uobičajeni LC instrumenti za robu su UV Vis detektori apsorpcije i detektori indeksa refrakcije (RI). Prvi je daleko manje svestran od FID-a u GC-u, a drugi ima nižu osjetljivost i nije prikladan za gradijentno eluiranje. Naravno, i GC i LC imaju neke vrlo osjetljive selektivne detektore,