1. Struktura i princip rada: Gasna hromatografija-masena spektrometrija (GC-MS) je uređaj koji gasnom hromatografu dodaje detektor masene spektrometrije. Plinski hromatograf koristi plin kao plin-nosač, zagrijava i isparava uzorak u plinsku fazu i prenosi ga duž hromatografske kolone do detektora. Maseni spektrometar gasne hromatografije takođe koristi gas kao gas nosač za zagrevanje i isparavanje uzorka u gasnu fazu. Međutim, nakon hromatografije, molekule uzorka se jonizuju pomoću izvora jona, stvarajući tok jona koji se prenosi do detektora masene spektrometrije radi detekcije. Nakon analize od strane analizatora, detektor snima signal kako bi se dobila informacija o sastavu uzorka. Stoga, gasna hromatografija-masena spektrometrija ima dvostruke prednosti gasne hromatografije-masene spektrometrije.
2. Osetljivost i rezolucija: Zbog dodavanja sloja detektora masene spektrometrije na vrhu gasnog hromatografa, osetljivost i rezolucija gasne hromatografije-masenog spektrometra su veće od onih kod gasne hromatografije-masenog spektrometra. Gasna hromatografija-masena spektrometrija može analizirati složenije uzorke i detektovati jedinjenja sa veoma niskim sadržajem.
3. Cena: U poređenju sa gasnim hromatografima, gasna hromatografija-masena spektrometrija (GC-MS) ima dodatni sloj detektora masene spektrometrije, tako da je i njena cena veća od cene gasne hromatografije. Pogodno za situacije u kojima se postavljaju visoki zahtjevi za tačnost detekcije, dubinu analize i osjetljivost u istraživanju.
Ukratko, gasna hromatografija-masena spektrometrija (GC-MS) kombinuje gasnu hromatografiju-masenu spektrometriju (GC-MS) sa detektorom masene spektrometrije, koji može analizirati složenije uzorke sa većom osetljivošću i rezolucijom. Pogodan je za situacije u kojima je u istraživanju potrebna visoka tačnost detekcije, dubina analize i osjetljivost, ali je i cijena veća.